公司在房屋转租时需要缴纳的税种主要包括以下几种：
房产税
根据《中华人民共和国房产税暂行条例》第四条，房产税的税率依照房产租金收入计算缴纳，税率为12%。
印花税
印花税是租赁双方在办理租赁登记时应按租赁合同所载租赁金额的千分之一贴花。
企业所得税
根据《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例，企业应纳税所得额为收入总额减去不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额。公司在转租房屋时取得的租金收入，应计入收入总额，依法计算并缴纳企业所得税。
增值税
根据《国家税务总局关于发布〈纳税人提供不动产经营租赁服务增值税征收管理暂行办法〉的公告》（国家税务总局公告2016年第16号），一般纳税人将2016年4月30日之前租入的不动产对外转租的，可选择简易办法征税，按照5%的征收率计算应纳税额；将2016年5月1日之后租入的不动产对外转租的，不能选择简易办法征税。简易计税办法：应交增值税=转租收入/（1+5%）*5%。
对于住房租赁企业中的增值税一般纳税人向个人出租住房取得的全部出租收入，可以选择适用简易计税方法，按照5%的征收率减按1.5%计算缴纳增值税，或适用一般计税方法计算缴纳增值税。住房租赁企业中的增值税小规模纳税人向个人出租住房，按照5%的征收率减按1.5%计算缴纳增值税。
城市维护建设税和教育费附加
根据实际缴纳的营业税的7%征收城市维护建设税，以及实际缴纳的营业税的3%征收教育费附加。
个人所得税
个人转租居住房屋，转租人按房屋租金的2.5%缴纳综合税款。
城镇土地使用税
拥有房屋产权的个人，出租的房屋位于城镇土地使用税开征范围内，应按房屋土地（含出租的院落占地）面积，计算缴纳城镇土地使用税。
综上所述，公司在房屋转租时需要缴纳的税种和税额如下：
房产税：租金收入的12%
印花税：租赁合同金额的千分之一
企业所得税：租金收入计入收入总额，依法计算并缴纳
增值税：一般纳税人简易计税办法为转租收入/（1+5%）*5%，一般计税办法为转租收入/（1+9%）*9%
城市维护建设税：实际缴纳营业税的7%
教育费附加：实际缴纳营业税的3%
个人所得税：转租居住房屋的租金收入的2.5%
城镇土地使用税：根据房屋土地面积计算缴纳
建议在实际操作中，公司应咨询当地税务机关或专业税务顾问，以确保合规并优化税务成本。
